Com todos os segmentos de ensino autorizados e reconhecidos, a escola movimentou-se no sentido de ampliar seus espaços, os quais, ano após anos, foram cuidadosamente pensados, construídos e preparados para possibilitar uma prática pedagógica de excelência. Um desses movimentos foi a instalação do primeiro laboratório de informática educacional da região, o que foi uma revolução em todo o processo educacional, pois na década de 1990 computadores eram novidade para alunos e também professores, os quais trocaram o mimeógrafo pela tecnologia da impressora.
Em 1998, o Colégio Atlântico abriu o ano letivo com uma piscina, investimento que possibilitou momentos muito significativos de recreação, convivência e integração no aspecto relacional entre os alunos.

O novo século trouxe mais avanços com a inauguração da quadra esportiva construída de acordo com as medidas oficiais, o que qualificou as aulas de Educação Física, uma vez que até o ano 2000 eram realizadas em uma cancha de areia. A partir daí surgiram as escolinhas de futsal, basquete, vôlei e handball, resultando em inúmeros troféus conquistados pelos alunos em campeonatos promovidos no município.
Em 2002, investiu-se na organização e adequação dos ambientes de acordo com a faixa etária dos educandos. Assim, foi inaugurado o atual Bloco de Ensino Médio, onde cada segmento de ensino passou a ter o seu próprio espaço. Dois anos depois, houve um resgate da história com a reconstrução do Bloco da Educação Infantil, que foi herança do Pequeno Príncipe. O espaço ficou mais amplo, lúdico, completo e seguro para atender crianças de todas as idades.

Chegou a hora de pensar mais no conforto e bem-estar de alunos e professores. Dessa forma, foram adquiridos aparelhos de ares-condicionados, primeiramente nas salas de aula, a partir de 2007 e, na sequência, para os demais ambientes. Em 2010, as salas do Ensino Médio receberam lousas digitais, equipamentos multimídias e internet, permitindo aos professores e alunos disporem de aulas, cujos métodos são mais modernos e dinâmicos.
Tais recursos deram vida nova aos professores e às aulas, pois foi possível apresentar conteúdos aos alunos de forma mais atraente. Dois anos depois, em 2012, foram instaladas as câmeras, oferecendo à escola a capacidade de monitoramento em tempo real e, consequentemente, garantindo mais prevenção, proteção e segurança.
Já 2015 foi o ano da modernização do Parque Infantil. O novo parque ficou mais colorido, atrativo, divertido e seguro. Com os novos brinquedos, o colégio proporcionou muito mais do que diversão, contribuindo com o desenvolvimento de habilidades corporais e mais destreza, proporcionando a interação e a superação de desafios às crianças. Vale lembrar que criança que brinca é criança feliz!

Em 2018, a quadra esportiva ganhou proteção nas laterais, tornando-se mais adequada para dias de frio e chuva. Lá acontecem as práticas esportivas e os eventos culturais da escola. A Biblioteca também ganhou cara nova em 2018. Com a reforma, foi possível inserir novos móveis e novos títulos, tornando-se mais convidativa, agradável, confortável e um espaço aconchegante para a leitura e letramento. Além da biblioteca, ainda em 2018, a piscina também passou por reformas: as antigas grades de ferro foram substituídas por uma nova proteção lateral de vidros, trazendo beleza, mais segurança e atratividade.
Outras melhorias aconteceram com certa frequência em banheiros, pátios, corredores, escadarias, rampas e telhados. A escola contempla áreas verdes, mantendo árvores e jardim. Todos estes espaços recebem manutenção regularmente.
A transformação mais recente nas instalações da escola aconteceu na Educação Infantil, que passou a ter acesso exclusivo, com entrada pela Rua 258, desconstruindo uma crença antiga de que o Colégio Atlântico era escola de alunos maiores. Apesar de a Educação Infantil ter sido o primeiro seguimento a existir em toda a história do Atlântico, tinha em comum com os demais segmentos a entrada principal da escola pela Rua 260A, gerando algum desconforto a quem desejava um espaço mais reservado para os pequenos.
Em 2019, a Educação Infantil, apesar de continuar sendo parte de um todo, está completamente reservada e recebe os alunos pela nova entrada, totalmente reformulada, propiciando mais privacidade aos pequeninos e dando mais tranquilidade às famílias.